陽明交通大學理學院成立於1979年。自成立以來，理學院始終堅持扎實的基礎科學和創新的科技應用之研究教學。30多年來的苦心經營與發展，陽明交通大學理學院已成為國內重要的學術研發與人才培育重鎮，在台灣高等教育與跨領域創新研究上以奠立的無可取代的地位。
陽明交通大學以成為「全人教育、科技創新、學術卓越」的偉大大學為總體目標，其發展必然仰賴科學、工程、管理、人文社會及藝術等領域的全面提升與充分融合，讓美的感動融入於科技的發展以創造更高的價值，使人文關懷結合於管理而成為另一種藝術的展現。透過培育、整合、超越、合作與競爭等策略，理學院的研究與教學亦為陽明交大的長遠發展、超越卓越和邁向頂尖，持續的向下紮根!
教學與研究並重，除著重基礎課程的訓練外，更規劃多元和創新的課程以激發學生在學術上和跨領域研究的興趣，並進一步延伸學生的視野至先進的科技應用。同時，也期能達到培養學生人文素養及社會關懷的全方位人才教育。藉由推動國際化與整合研究，使學生具備國際視野、溝通與統合的領導能力。
科學素養 Science discipline
公民責任 Citizen's responsibility
品德涵養 Moral character and self-restraint
人文關懷 Caring for the culture of humanity and locale
人文藝術陶冶 Culture and art cultivation
科學專業知能 Professional skills and knowledge in science
國際視野 International perspective
外語能力 Foreign language ability
發現及解決問題的能力 Problem discovery and solving ability
跨界多元思考的能力 Cross-discipline, diverse thinking ability
群己平衡的認知 The balance of the collective and the self
現有105位專任教師，3位教育部終身榮譽國家講座主持人、6位國家講座、4位院士(3位中研院院士及一位海外院士)以及12位交大終身講座，師資優良，並積極延攬國際優秀研究人才與學者。